Bon, si on remonte la théorie, pour moi le monde des Ténèbres est Lorule. Pas à la même époque non, dans ALTTP, le monde des Ténèbres n'est autre que la terre d'or profanée par Ganon, qui prend donc cette apparence. Mais ce monde, qui abrite des créatures, des humains qui se sont transformés en monstre (le bestiaire est le même, les donjons quasiment les mêmes aux mêmes endroits, la même typographie). Je pense que la Triforce de Lorule est la même que celle d'Hyrule, on ne sait rien de la création de Lorule, de ses déesses mais il est fort probable que ce soit les mêmes déesses qui ont fondé Hyrule, qui ont du fonder Lorule. La terre d'or est dans l'histoire de la saga, le lieu ou elle a été enfermé bien plus tard par les premiers Hyliens qui ont fondé Hyrule et fait construire le temple du temps. Ils ont trouvé un monde ou cacher la Triforce. Peut-être que ce monde était bel et bien Lorule.
Le Lorule d'ALBW est le même monde que celui d'ALTTP mais dévasté par la perte de la Triforce ce qui cause ces failles énormes au niveau des rivières, qui ont pour effet de fragmenter le monde. Avec pour habitant les hommes qui avaient pénétré cette terre, des siècles avant, pour trouver la Triforce.
Pour expliquer la non transformation de Link en créature, il dispose du bracelet de Lavio, peut-être que celui-ci offre le même effet que la perle de lune ?
Pour finir, même si l'histoire des deux royaumes ne collent pas forcément entres elles, il ne faut pas oublier que ce sont devenues des légendes quand on nous les racontes, des légendes perdus à travers les siècles, là ou les paroles ont pu être déformé avec le temps.
Pour ce qui est de relier le monde du Crépuscule à Lorule ou au monde des Ténèbres, je trouve ça impossible. Le Crépuscule est un royaume créé par les Déesses pour bannir les plus grands criminels de l'histoire d'Hyrule. Un lieu qui ne sert que de sentence, pire que la prison ou tout simplement la mort.
Bref, depuis tout ce temps, ça ne servira plus à grand chose pour les avis pour notre cher Yorick, mais autant profiter que la théorie ait été remontée pour donner son avis.
EDIT : Pour aller plus loin, surtout au niveau de Yuga que j'avais pas évoqué, il s'agir il me semble dans l'histoire, d'un ancien prêtre de Lorule, prêtre qui chercher à réveiller un démon scellé en scellant (comme Aghanim l'avait fait) les descendants des sages. Je ne crois pas que la force démoniaque scellé dans le château soit expliqué à un moment ou un autre dans l'histoire (je l'oublie peut-être, ça fait longtemps que j'ai pas fait le jeu) mais le château de Lorule est créé à l'endroit même ou se trouvait la Pyramide des Ténèbres. Le seul démon qui a été scellé à cet endroit n'est autre que Ganon dans l'ancien monde des Ténèbres dans ALTTP. Le fait que Yuga devienne Yuganon ne laisse plus vraiment de doute sur le fait qu'il puisse s'agir du même démon (ou alors c'est juste un petit clin d'oeil dans le nom, mais ça ferait énormément de clin d'oeil dans le jeu entier).