Voici une liste des 20 joyaux de la sagesse :
1) Île du feu, notre amie Astrid, la voyante, le donne après avoir que nous ayons sauvé l'esprit de la sagesse.
2) Sur l’île Mercay, aller sur la petite île au Nord-Est de l'île et allez à droite de Feedle pour trouver un coffre contenant un Joyau de la Sagesse.
3) Au SS9 du temple du Roi des mers, il faut tuer tous les Faucheurs Fantômes (les montres qui volent du temps) ce qui aura pour effet de faire apparaître un coffre.
4 Au SS2 du temple du Roi des Mers, au Nord-ouest, faites exploser le mur. Envoyez une Bombshu pour activer l'interrupteur à travers le trou ce qui aura pour effet de faire apparaître un coffre.
5) Île de Sazu, en utilisant l’un poulet pour voler jusqu'à la plateforme à Droite de la maison de Sazu.
6) Île Molida, au premier Sous-sol du Temple du Soleil. Il faut se frayer un chemin jusqu'au côté droit de la salle en utilisant les plateformes mobiles. Allez ensuite jusqu'à la plateforme grâce à l'escalier. Là, il ne faut surtout pas monter mais se placer à gauche et utiliser le Boomerang pour changer la direction du Tireur Magique bleu jusqu'à ce qu'il pointe vers le haut. Il suffit ensuite de tirez une flèche sur le Tireur Magique pour toucher un Œil Magique et faire apparaitre un coffre.
7) Île Bannan. Il faut livrez la lettre de Jolène sa sœur, la Sirène dans la maison du vieux voyageur.
8 ) Île Molida, après avoir monté les escaliers dans la cave secrète du vieux voyageur, (ceux menant à l'extérieur), qui mènent en direction du temple du soleil, vous trouverez un endroit où vous devez creuser pour révéler un second trou. Sautez dedans pour trouver un coffre.
9) Île des Glaces, la colline près d’Anouku très sensible renferme un trésor. Elle se trouve à côté des deux maisons de la première Zone de l'île. Il est nécessaire d’utiliser le Grappin pour l'atteindre.
10) Île du vent, dans la Première grotte que vous trouverez sur l'île. Elle renferme un coffre avec le Joyau à l'intérieur. Il est cependant nécessaire de tuer tous les monstres pour que le coffre apparaisse.
11) Île des Glaces
Dans le temple de la Glace, SS1. Tirez sur l'Oeil Magique avec une flèche puis, tirez le levier pour faire fondre la glace et pousser la boite hors du chemin pour atteindre le coffre.
12) Île des Gorons, ce joyau est donné par chef Goron après avoir réussi son petit questionnaire.
13) Île des Glaces, au troisième étage du Temple de la Glace. Il faut lancer une Bombe sur l'interrupteur à l'ouest afin d’ouvrir la porte bleu. Ensuite, il faut descendre du pont de glace pour rejoindre le coffre qui contient le très recherché joyau.
14) Île dédale, le joyau se trouve dans un coffre se trouvant dans la section Est du labyrinthe, faites exploser le mur pour accéder au coffre. Vous devez cependant dépenser une partie pour l’obtenir alors essayez de le faire avant de monter la difficulté du mini jeu ça vous coûtera moins cher.
15) Île des Ruines, lorsque vous avez fait descendre l'eau dans la tombe de Bremeur. Rendez-vous à l'ouest, puis allez au sud, poussez le gros rocher sur un autre gros rocher à l'est pour le détruire et pour atteindre un coffre.
16) Île dédale encore, en finissez le mode facile du Labyrinthe.
17) Île des Ruines, lorsque vous avez fait descendre l'eau, allez dans la cave du Nord-Ouest. Pour la localiser sur votre carte, il vous suffit de regarder près de la pyramide en haut à gauche.
18 ) Lettre de Aroo, quand vous avez terminé le temple de la Glace.
19) Océan, il faut l’acheter à Beedle pour 500 rubis.
20) Lettre de Salvatore sur l'île Bannan après avoir joué au Mini-Jeu du Bateau pour la première fois.
Voici l'emplacement des 20 joyaux du courage :
1) Dans un coffre sur l'île des esprits.
2) Sur l'île de Melka, elle se trouve dans un coffre, dans le tunnel menant vers "l'homme aux boites magiques".
3) Sur l'île du vent, dans la caverne ou l'aventurier a laissé une table et des livres.
4) Sur l'île des Molida, au deuxième étage du donjon, dans un coffre
5) Sur l'île du vent, dans un coffre au premier sous-sol du donjon.
6) Sur le bateau de Terry avec le masque (bateau mystère), vous pouvez l'acheter pour 500 rubis.
7) Sur l'île des Esses, il faut tuer les deux cyclopes sur ce qui ressemble à l'écran du haut de la DS, puis récupérez le contenu du coffre qui apparaît alors.
8 ) Sur l'île des Esses, creusez sur l'équivalant de l'écran menu de votre console.
9) Au huitième sous-sol du temple du Roi des mers, il faut placez le triangle sur son piédestal afin de faire apparaitre un coffre contenant le joyau du courage.
10) Sur l’île du feu, le joyau se trouve sur une petite plateforme au nord que vous pouvez également rejoindre en utilisant votre grappin.
11) Sur l’île du Parrain (chef des grenouilles), il se trouve dans la grotte, et est accessible uniquement avec le grappin.
12) Sur l'île Molida, un coffre se trouve près de l'entrée du temple, il est accessible grâce au grappin.
13) Sur l'île Goron, le joyau est en hauteur, près du goron qui regarde le bateau, il est nécessaire de faire le tour et d’utiliser le grappin pour l'attraper.
14) Sur l'île Bonnan, le coffre contenant le joyau se trouve derrière le jeu du canon. Il faut le grappin pour y accéder.
15) Sur l'île des ruines, après avoir récupéré le dernier minerai, allez à gauche de la petite pyramide du nord-est et ouvrez le coffre.
16) Après avoir récupéré le troisième minerai, Ptigoron vous envoie un message accompagné d'un joyau, allez donc voir votre boîte aux lettres.
17) Sur l'île des morts, placez une bombe sur le mur de gauche de la caverne contenant des livres pour trouver un joyau.
18 ) Pour obtenir le joyau, faites vous abords en mer deux ou trois fois par les pirates (les vrais pirates, pas Jolène).
19) Sur l'île des morts, une goutte se trouve dans un coffre au deuxième sous-sol du donjon.
20) Au premier sous sol du temple du Roi des mers, le joyau est dans un coffre accessible en utilisant le grappin et l'arc.